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Le réseau MERIT national a tenu une réunion le matin du 30 juin, en marge de JOBIM 2026 à Strasbourg, où chaque réseau local de bioinformatique de France a eu quelques minutes pour décrire ce qu’il fait, combien de personnes il rassemble, et ce qui a ou n’a pas fonctionné. Nous avons pu voir à quel point ces réseaux se sont développés différemment d’une ville à l’autre. Une session fort instructive! Certains d’entre eux remontent à 2015, voire avant ; le nôtre, à Lyon, est l’un des plus jeunes, avec une liste de diffusion créée seulement en mai 2024, mais qui a connu une croissance rapide, comme le montre le graphique ci-dessous : ...

ReBiLy a été invité à présenter sa structure et ses activités lors d’une réunion MERIT le matin du 30 juin 2026, organisée en marge de JOBIM 2026 — la conférence nationale de bioinformatique — à Strasbourg. À cette occasion, voici un aperçu de notre liste de diffusion. À ce jour, la liste de diffusion ReBiLy (reseau_bioinfos_lyonnais@groupes.renater.fr) compte 177 abonnés. Voici une répartition de l’origine de la communauté, regroupée par nom de domaine de l’adresse électronique de chaque abonné. ...

Le site web de ReBily est ouvert! Il utilise Hugo on codeberg. Envoyez vos nouveaux articles en cr�ant un pull request.

Le Conseil d’Analyse Numérique (CAN) de la SFR BioSciences organise une formation pratique sur l’analyse d’expression différentielle à partir de données RNA-seq en bulk. L’objectif : maîtriser toutes les étapes de l’analyse, depuis les fichiers bruts issus du séquenceur jusqu’à l’interprétation des résultats, sans prérequis technique. Cette formation est particulièrement adaptée aux personnes disposant déjà d’un jeu de données RNA-seq, qu’il s’agisse de données publiques issues d’articles ou de données générées dans le cadre d’un projet de recherche. ...

LabCluster organise une demi-journée technique dédiée à la préparation d’échantillons, la biologie spatiale et l’analyse de données. Jeudi 10 avril 2025, 8h30 à 14h30 Bâtiment principal, salle Hermann — Domaine Rockefeller, Université Claude Bernard Lyon 1, 8 avenue Rockefeller, 69008 Lyon Participation gratuite sur inscription, places limitées : www.labcluster.com Programme Horaire Intervenant Titre 8h30 Accueil — café et viennoiseries 9h00–9h20 Guillaume Marcy (plateforme bioinformatique, Labex CORTEX) Sample Preparation and Cell Isolation Methods for Single-cell Transcriptomics – Best Practices and Advice 9h20–9h40 Levitas Bio Overcoming Sample Quality Challenges for Single Cell Analysis 9h40–10h00 Singleron Biotechnologies « Instrument free » Multi-Omic Single Cell Sequencing technology for your research 10h00–10h20 NanoCellect The Future of Image-Guided Cell Sorting 10h20–10h40 Arralyse (dist. NewcellX) Bridging Spatial Insights with Functional Single-Cell Analysis 10h40 Pause café 11h00–11h20 Akoya Biosciences Single-Cell Spatial Phenotyping: Setting the pace of Discovery and Translational Research 11h20–11h40 RareCyte Unlocking Spatial Biology with Orion™ Technology 11h40–12h00 Standard BioTools Unlocking New Views in Spatial Biology with Imaging Mass Cytometry 12h00–12h20 Visiopharm Mapping the biological landscape: Turning multiplex images into knowledge 12h30–14h30 Labolunch — cocktail déjeunatoire

Lors de notre première réunion en présentiel, en septembre 2024, nous avions noté qu’une “charte déontologique” était nécessaire pour la liste de diffusion. Le mot était peut-être un peu sévère, mais le besoin était réel. Voici chose faite : ReBiLy se dote d’un code de conduite. La plupart des codes de conduite de réseaux ou de conférences traitent du harcèlement, des discriminations, des comportements intimidants. C’est indispensable, et le nôtre le fait. Mais une communauté scientifique a aussi ses propres travers, moins souvent nommés explicitement. Nous nous sommes appuyés sur la charte de bonne conduite de la SFBI et avons cherché à aller un peu plus loin sur quelques points. ...

Présentiel — Salle Condorcet, ENS de Lyon — 2 décembre 2024 Participants 41 participants en présentiel, 3 en visioconférence. Rappel des objectifs du réseau Fédérer la communauté bioinformatique lyonnaise au sein d’un même réseau. Relayer les informations et actualités locales (annonces de séminaires, etc). Encourager les échanges et le partage d’expertise. Fournir un soutien spécifique aux membres de la communauté. Informations générales En octobre 2024, le réseau comptait 83 inscrits sur la liste de diffusion; au 2 décembre, suite à l’annonce de la présente réunion, ce nombre est de 157 abonnés et 58 membres ont déjà contribué à la constitution de l’annuaire. ...

Bonjour à toutes et tous, Le Réseau Lyonnais Bioinfo a la plaisir de vous convier à sa deuxième réunion, qui se déroulera le lundi 2 décembre 2024 à 13h30 en salle Condorcet de l’ENS de Lyon. Dans la perspective de cette réunion, nous constituons un annuaire des membres du réseau afin de faciliter les échanges au sein de la communauté. Vous serez contactés à ce sujet. L’ordre du jour sera le suivant : ...

Présentiel — Salle 34290, INMG, Faculté de Médecine Lyon Est, campus Rockefeller — 10 septembre 2024, 13h–15h Participants Présents : 17 participants issus de 8 structures de recherche. Excusées : 3 personnes. Profil : 10 contractuels et 7 titulaires. La grande majorité travaille sur des données génomiques et transcriptomiques, avec une tendance certaine vers le single-cell et la transcriptomique spatiale. Introduction Ce premier rassemblement part d’un constat partagé : la communauté bioinformatique lyonnaise est peu représentée dans les réseaux nationaux. L’objectif est de créer des liens, de structurer un réseau local, et de disposer d’un espace d’échange et d’entraide. ...

Bonjour à toutes et tous, Depuis mi-mai 2024, un groupe de bio-informaticiens localisés sur le pôle de recherche Lyon-Est travaille à la création d’un réseau local lyonnais dédié à l’ingénierie en bio-informatique, avec pour ambition de fédérer la communauté bio-informatique de la région lyonnaise. Les objectifs de ce projet sont : Travailler de concert avec le réseau national MERIT, qui fédère les ingénieurs en bioinformatique à l’échelle nationale sous l’égide du CNRS, et contribuer à l’émergence d’une antenne lyonnaise labellisée au sein de ce réseau. Favoriser le partage de connaissances entre les membres du réseau. Offrir un espace d’échange dédié à la bio-informatique pour les ingénieurs parfois isolés au sein de leurs structures. Permettre aux professionnels de la bio-informatique de se rencontrer et de partager leurs expertises. Le réseau est ouvert aux professionnels de la bio-informatique des laboratoires académiques et privés de la région lyonnaise. ...